Точная дата основания поселка неизвестна. В конце 19 века в затоне Гоголь образовались два кожевенных завода. Они принадлежали Михаилу Губкину и Андрею Давыдову. Здесь же, на берегу располагались их дачи. Позднее здесь построили свои дачи трубчевские купцы Мерцеровы и Курындины. Всего на берегу Гоголя было построено 24 дачных домика. Все они были окрашены в голубой цвет. В центре поселка располагалась дачная площадь. На площади были разбиты клумбы с цветами, построены качели.

Справа от реки был построен особняк Агафьи Яковлевны Бороденка. Здесь у нее был постоялый двор, за ночлег она брала плату 5 копеек. Возле особняка стоял большой колодец. Здесь проходили церковные обряды.

В 1917 году заводы национализировали. В особняке Агафьи Яковлевны был устроен приют, а ее назначили заведующей. С 1919 года поселок стал называться Бороденка.

Существует легенда о происхождении названия поселка, которую рассказала научный сотрудник краеведческого музея Е. А. Мухамедьянова:

«Шли три путника. Дошли они до берега реки Десны и решили отдохнуть. Очень им это место приглянулось и они решили здесь остаться. Долго спорили о том, как назвать это место и потом решили, что утро вечера мудренее, а утром, как проснуться, какое первое слово произнесут, так и назовут. У одного из них была небольшая бородка. Вот проснулся утром его сосед, дернул за бороду и сказал: «Бороденка, вставай, просыпайся!» Так и получилось, что назвали это место Бороденка».