Трудовую деятельность Анатолий Николаевич Заикин начал в 1966 году рабочим Кокоревского мебельного комбината. После службы в рядах Вооруженных Сил СССР (1968-1970 гг.) в 1970 году поступил в Брянский технологический институт (ныне БГИТУ).
В 1975 году, после окончания вуза, работал младшим научным сотрудником на кафедре механизации лесной промышленности и лесного хозяйства БТИ (ныне БГИТУ).С 1976 года – преподаватель этой кафедры. В 1978 году поступил в аспирантуру Московского лесотехнического института, окончив которую в 1981 году, продолжил работать на кафедре механизации лесной промышленности и лесного хозяйства БТИ (ныне БГИТУ).
В 1984 году защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата технических наук.
С 1986 по 1997 год - заведующий кафедрой механизации лесной промышленности и лесного хозяйства БТИ. За это время им проведена большая работа по ремонту, переоборудованию и оснащению вычислительной лаборатории.
С 1993 по 2016 год– декан механико-технологического факультета.
С 2011 по 2016 год- заведующий кафедрой оборудования лесного комплекса БГИТУ.
В 2010 году Анатолий Николаевич защитил докторскую диссертацию, и ему была присвоена ученая степень доктора технических наук.
Научные интересы: «Моделирование и организация производственных процессов лесного комплекса», «Машины и оборудование лесозаготовок».
Ученый внес большой вклад в разработку научного обеспечения экологически безопасной технологии заготовки и переработки древесины на территории Брянской области, реализовав ряд важнейших научно- исследовательских программ. Усовершенствованные имитационные модели для определения обоснованного состава, объемов запасов, режимов их создания, пополнения, потребления и выработки; методы организации и управления работой комплектов машин; рекомендации и методическое сопровождение по их использованию внедрены на ряде лесозаготовительных предприятий Кировской и Свердловской областей, Усть-Илимского ЛПК, на лесозаготовках ГУП «Дятьковский лесхоз», ООО «ЛПК Навля» и ООО «Клетнянский лес» Брянской области.
По результатам научных исследованийдоктором технических наукА. Н. Заикиным опубликовано более 250 научных и учебно-методических работ, из них: 4 монографии, 18 учебных пособий с грифом УМО, 4 текста лекций, 7 патентов на изобретения и полезные модели, 5 программ для ЭВМ.
Награжден: Почетной грамотой Министерства образования и науки РФ (2000 г.), Благодарностью Брянской областной Думы (2003 г.), Благодарностью Губернатора Брянской области (2003 г., 2004 г., 2006 г.), Почетной грамотой Губернатора Брянской области (2006 г.).
Профессор А. Н. Заикин – академик , «Почетный работник высшего профессионального образования Российской Федерации».
В 2023 году за личные заслуги в сфере научной и научно-технической деятельности, получившей широкое общественное призвание и способствующей развитию и повышению авторитета Брянской области, а также за большой вклад в развитие молодежного научного потенциала, привлечение к научно-исследовательской работе студентов, аспирантов и молодых ученых, подготовку квалифицированных инженерных кадров профессору кафедры транспортно-технологических машин и сервиса Института лесного комплекса, ландшафтной архитектуры, транспорта и экологии ФГБОУ ВО «Брянский государственный инженерно- технологический университет», доктору технических наук, доценту Заикину Анатолию Николаевичу было присвоено почетное звание «Заслуженный учёный Брянской области» (постановление Брянской областной Думы от 19.12.2023 № 7-1444).
Брянская областная Дума, г. Брянск, 25.01.2024 г.